จุดเริ่มต้นของสหพันธ์นิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตรแห่งประเทศไทย (สนภท.) เกิดจากการรวมตัวกันของนิสิตนักศึกษาคณะเภสัชศาสตรเ์พื่อทํากิจกรรมเกี่ยวกับวิชาชีพ 
ในปีพ.ศ. 2518 มีการรวมตัวกันของนิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์ 3 มหาวิทยาลัย ได้แก่ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ และมหาวิทยาลัยมหิดล

       

        ต่อมาในปี พ.ศ. 2529 ได้มีการรวมกลุ่มรวมกลุ่มครั้งสำคัญของนิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์ เพื่อเรียกร้องเกี่ยวกับวิชาชีพในเรื่อง ของใบประกอบโรคศิลป์ และร่วมกันทำกิจกรรมเพื่อสังคม โดยมีมหาวิทยาลัย รวมทั้งสิ้น 6 มหาวิทยาลัย ได้แก่ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ มหาวิทยาลัยมหิดล มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น และมหาวิทยาลัยศิลปากร 
 

        หลังจากนั้นได้มีการรวมกลุ่มขยายเครือข่ายนิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์ ตามจำนวนคณะเภสัชศาสตร์ที่เพิ่มขึ้นในประเทศไทย และผ่านการรับรองจากสภาเภสัชกรรม จนกระทั่งครบ 12 มหาวิทยาลัย จึงได้ตั้งชื่อเป็น สโมสรนิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์แห่งประเทศไทย และได้ยกระดับเป็นสหพันธ์นิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์แห่งประเทศไทย หรือสนภท.นั่นเอง โดยมีตัวแทนนิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์จากทุกมหาวิทยาลัยเข้าร่วมเป็นคณะกรรมการบริหารสหพันธ์ฯ และมีนิสิตนักศึกษาเภสัชศาสตร์ทุกคนจากทุกมหาวิทยาลัยทั่วประเทศไทยร่วมเป็นสมาชิก ปัจจุบันสนภท.มีสมาชิกทั้งหมด 20 มหาวิทยาลัย ดังนี้

​

1. จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย

2. มหาวิทยาลัยเชียงใหม่

3. มหาวิทยาลัยมหิดล

4. มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์

5. มหาวิทยาลัยขอนแก่น 

6. มหาวิทยาลัยศิลปากร

7. มหาวิทยาลัยรังสิต 

8. มหาวิทยาลัยนเรศวร

9. มหาวิทยาลัยหัวเฉียวเฉลิมพระเกียรติ

10. มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี

11. มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ

12. มหาวิทยาลัยมหาสารคาม

13. มหาวิทยาลัยสยาม

14. มหาวิทยาลัยพายัพ

15. มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์

16. มหาวิทยาลัยอิสเทิร์นเอเชีย

17. มหาวิทยาลัยบูรพา

18. มหาวิทยาลัยพะเยา

19. มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์

20. มหาวิทยาลัยเวสเทิร์น